特洛伊木马是一个程序，这个程序可以做程序设计者有意设计的未出现过的事情。但是对于特洛伊木马所做的操作，不论是否用户了解，都是不被赞同的。
根据某些人的认识，病毒是特洛伊木马的一个特例，即：能够传播到其他的程序当中（也就是将这些程序也变成特洛伊木马）。
根据另外的人的理解，不是有意造成任何损坏的病毒不是特洛伊木马。最终，不论如何定义，许多人仅仅用“特洛伊木马”来形容不能复制的带有恶意的程序，以便将特洛伊木马与病毒区分开?
特洛伊木马是木马屠城记里，希腊军队在特洛伊战争中，用来攻破特洛伊城的那匹木马。木马屠城记一直被现代科学人视为神话故事，直至十九世纪时，业余考古学者海因里希·施利曼（Heinrich Schliemann）才证实特洛伊城的遗址。
据荷马与希腊神话所载，这个故事的起因是源自一个金苹果。 这个故事的开端，就是海洋女神忒提斯（Thetis）与希腊国王佩琉斯（Peleus）的婚礼，原本宙斯与忒提斯相恋，但那时传说忒提斯的儿子（也就是未来的阿基里斯（Achilles））会比他的父亲还强大，宙斯害怕当年推翻他父亲的事重演，于是将她嫁给了著名英雄佩琉斯，避免影响他的政权。婚礼上邀请了很多神，唯独麻烦女神埃里斯（Eris）没有被邀请。
她很生气，便抛出一个金苹果，刻着“献给最美丽的女神”。智慧女神雅典娜、爱神阿芙罗狄忒和天后赫拉都认为自己最有资格冠上苹果上最美丽女神的美誉。为了解决这个难题，最后她们飞到艾达山请求特洛伊王子帕里斯仲裁。三个女神都试图贿赂帕里斯：雅典娜答应让帕里斯成为世界上最睿智的学者；希拉答应让帕里斯成为天底下最有权势的君王；阿芙罗狄忒则以世界上最美丽的女子作为贿赂。
最后帕里斯忠于感官天性选择了阿芙罗狄忒。作为回报，阿芙罗狄忒施行魔咒，让斯巴达王国的王后，公认为世界上最漂亮的女人海伦和帕里斯共坠爱河。海伦为了爱情抛弃了她的家乡，丈夫墨涅拉俄斯还有稚女。帕里斯的行动惹怒了斯巴达国王墨涅拉俄斯，其怒不可抑，于是向兄长阿伽门农求援，并联合希腊各城邦向特洛伊宣战。
斯巴达国王墨涅拉俄斯因为妻子海伦被帕里斯抢走，因此向希腊各城邦求助，共同出兵特洛伊。总计有一千艘希腊战船及五万名士兵参战。这场战争一打就是十年。但特洛伊因为有亚马逊女战士和黎明女神儿子梅农的帮忙，与阿芙罗狄忒暗中协助，所以能抵抗希腊联军。联军统帅阿加曼农因为将亲生女儿献祭等原因获得宙斯、赫拉等神助，雅典娜因为得不到金苹果不愿放过特洛伊，而且指示奥德修斯向希腊联军献上木马屠城之计。
他们打造一只巨大的木马，里面躲著伏兵并佯装撒退，让特洛伊人将其当作战利品带回城内，借此攻入特洛伊。希腊人进入特洛伊城后，烧杀掳掠，最后带着战利品满载而归。中途雅典娜因为希腊军人冒犯其祭司征得宙斯同意发起风暴，只有极少数人生还。联军统帅阿加曼农回国后被王后及其奸夫所杀，后二人又被阿加曼农的儿子所杀。
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